Из приведенных схем генетических дистанций очевидны прежде всего различия между геномами исследованных микроорганизмов. Большие генетические дистанции наблюдаются между возбудителями туберкулеза, с одной стороны, и атипичными микобактериями — с другой. Особенно четко это видно при использовании праймера № 19 (генетическая дистанция более 0,565). Напротив, большее сходство наблюдается внутри кластера типичных Читать полностью »
Возникает главный вопрос: существуют ли «общие» гены, контролирующие иммунитет к различным видам микобактерий (слабовирулентным BCG/MOC, более вирулентным — М. leprae и М. tuberculosis). Один ген может быть вовлечен в три уровня генетического контроля, с редкими мутациями, которые отвечают за менделирующую восприимчивость к BCG/MOC (и к более вирулентным видам — в случае их воздействия), с относительно Читать полностью »
Очевидно также, что только немногие гены-кандидаты были тестированы, а многие другие могут оказаться потенциально важными, так же как те, которые вовлекаются в менделирующую предрасположенность к ми-кобактериальным болезням и/или во многие пути (идентифицированные у мышей), которые вызывают иммунный ответ к микобактериям. В любом случае, для того, Читать полностью »
Члены ее не должны быть родственниками (как обследуемые), но должны быть максимально схожими с больными по этническому происхождению, возрасту, а в идеале — по уровню подверженности инфекции. Неправильное определение некоторых из этих факторов или наличие смешанной популяции может значительно повлиять на устойчивость и эффективность анализа. Изучение связей, основанное на исследовании семей, исключает необъективность, возникшую при отборе контроля. Изучение сцепления так же, как и изучение Читать полностью »
Гены-кандидаты могут быть выявлены на моделях животных, редких индивидуумах с острыми проявлениями заболевания или на основании гипотезы, учитывающей патогенез, иммунологию болезни и функции гена. К сожалению, ассоциативные исследования часто дают нестабильный результат. Причинами этого могут быть непропорциональные размеры образцов, недостаток коррекции многократных сравнений, неудачный Читать полностью »
— термостабильная ДНК-полимераза (Taq – или Tth-) с активностью не ниже 1 ед/мл;
— буфер для ПЦР;
— смесь динуклеотидтрифосфатов (dNTPs), в состав которой входят: дезокси-АТФ, дезоксиГТФ; дезоксиЦТФ; дезоксиТТФ;
— вода деионизированная, бидистиллированная, стерильная;
— специфические праймеры (олигонуклеотиды) прямой и обратный для детекции возбудителя;
— альбумин бычьей сыворотки (БСА), свободный от нуклеаз Читать полностью »
Синдром гетерогенный, хотя его клиническое проявление, вероятно, ограничивается проявлением восприимчивости к микобактериальной инфекции.
Во-первых, генетический дефект разнороден в различных семьях. В большинстве из обследованных семей патология наследуется по аутосомно-рецессивному типу. В одной семье прослеживали Х-сцепленное рецессивное наследование, в нескольких семьях — аутосомно-доминантное Читать полностью »
Инфекции, вызванные BCG и микобактериями окружающей среды (МОС), в целом считаются редкими, но могут учащаться в определенных эпидемических условиях. Повреждение кожи, госпитальное заражение могут способствовать развитию этих инфекций. Им также благоприятствуют приобретенные иммунодефициты, включая СПИД, лейкемию, пересадку красного костного мозга, органов. Муковисцидоз — наиболее частое менделирующее нарушение в популяции Читать полностью »
Маркеры хромосомы 15 и Х-хромосомы позволяют предположить их связь с туберкулезом. Такие исследования продолжаются для составления полной карты генома, на которую можно нанести гены восприимчивости к туберкулезу.
Так называемое модельное исследование сцепления, предполагавшее наличие аллеля предрасположенности к туберкулезу, было проведено в племени канадских аборигенов. Оно показало наличие зависимости между туберкулезом и локусом 2q35, содержащим NRAMPL
Необходимость Читать полностью »
Обычно изучение сложных заболеваний с неизвестным типом наследования не может основываться на моделировании. В таких случаях используют анализ сцепления генома с обследованием большого количества семей, в которых имеются два и более больных потомка. При использовании микросателлитных маркеров были идентифицированы участки хромосом, в которых выявлено неслучайное наследование маркерных участков больными.
Исследование Читать полностью »